Experimentální a klinická onkologie

Charakteristika studijního programu

Doktorský studijní program Experimentální a klinické onkologie poskytuje komplexní ucelené vzdělání ve všech oblastech, od obecných a experimentálních, přes preklinické až po klinické oblasti onkologie. 

Druhým, neméně důležitým cílem doktorského studia je osvojení si základních principů vědecké práce: studium literatury, příprava vědeckého projektu, formulace hypotéz, základní a pokročilé statistické metody (včetně a priori kalkulace potřebné velikosti souboru), vlastní realizace výzkumného projektu, sběr, analýza a kritická interpretace dat, formulace závěrů, příprava rukopisu a jeho úspěšné uveřejnění v recenzovaném časopise s impaktovým faktorem. Důležitou součástí této oblasti je také schopnost připravit odborné sdělení (přednáška, poster), jeho prezentace a obhajoba v diskusi na odborných kongresech, sympoziích a konferencích (tuzemských i zahraničních).

Třetí oblastí je schopnost doktoranda samostatně připravit grantovou aplikaci, včetně všech souvisejících náležitostí (mezinárodní registrace klinického projektu – Clinical.Trial.gov, povolení práce s geneticky modifikovanými organismy, práce s radioizotopy, etická komise, SÚKL aj.) a zajistit tak finanční krytí výzkumu. 

Úspěšné dokončení doktorského studia je východiskem pro další akademickou dráhu absolventa.

Vypsaná témata 

 

Požadavky v průběhu studia

1. ročník

• Zkouška z anglického jazyka (D0400003)
• Absolvování kurzu prezentačních dovedností nebo jiného kurzu zaměřeného na prezentaci vědeckých výsledků (např. DS001, MPGS0029, B90068, CPGS005)
• Absolvování nejméně jednoho kurzu metodologie experimentálního a/nebo klinického výzkumu (např. CPGS005 a výše) nebo kurzu biomedicínské statistiky (např. B90206)
• Stáž na tuzemském pracovišti (minimální délka 1 měsíc)
• Napsání přehledového článku o studované problematice a jeho odeslání do recenzovaného časopisu (může jít i o tuzemský časopis bez IF). Ke splnění povinnosti stačí full-text článku + potvrzení o odeslání do časopisu. Není nutné, aby článek během 1. roku studia byl již časopisem přijat. Další doporučené studijní povinnosti (jejich případné nesplnění musí být písemně zdůvodněno studentem, odsouhlaseno školitelem a student se musí zavázat k jejich splnění ve 2. roce studia.)

2. ročník

• Prezentace v angličtině na odborné konferenci v ČR nebo zahraničí. Prezentace nemusí nezbytně obsahovat již první vědecké výsledky, ale může jít jen o přehledové sdělení či kasuistiku. Student musí být jak prezentujícím, tak i prvním autorem. Další doporučené studijní povinnosti (jejich případné nesplnění musí být písemně zdůvodněno studentem, odsouhlaseno školitelem a student se musí zavázat k jejich splnění ve 3. roce studia.)
• Zahraniční stáž (DS025, délka min. 1 měsíc, alternativně zapojení se do mezinárodní spolupráce na grantu atd.)
• Absolvování povinných kurzů

3. ročník

• Spoluautorství nejméně 1 článku in-extenso v časopise s impaktovým faktorem vyšším než 1,5
• Prezentace (jako 1. autor) vlastních vědeckých výsledků v angličtině nejméně na jednom mezinárodním kongresu či konferenci v zahraničí
• Absolvování SDZ

4. ročník

• Druhá prezentace vlastních výsledků na mezinárodním kongresu (první autor)
• Vědecká konference 2. LF UK
• Stěžejní publikace získaných výsledků v mezinárodním časopise s impaktovým faktorem vyšším než 1,5 (student je prvním autorem nejméně jednoho článku s vlastními výsledky, publikovaného in-extenso). Tento stěžejní článek nemůže být pouhým abstraktem, kasuistikou ani přehledovým sdělením.
• Sepsání a obhajoba doktorské dizertační práce

Požadavky na absolvování stáží

• Stáž na tuzemském pracovišti (minimální délka 1 měsíc)
• Zahraniční stáž (DS025; délka min. 1 měsíc, lze nahradit zapojením se do mezinárodní spolupráce na grantu atd.)

Vypsané kurzy

B90280 Experimentální onkologie – povinný kurz; bude možno absolvovat v LS AR 24/25, sylabus bude dostupný koncem roku 2024

B90281 Klinická onkologie – povinný kurz; bude možno absolvovat v LS AR 24/25, sylabus bude dostupný koncem roku 2024

DS001 Kurz základů vědecké činnosti

MPGS0029 Kurz základů vědecké práce

B90068 Základy vědecké práce v AV ČR

CPGS005 Úvod do praktické metodologie vědecké práce

B90206 Biomedicínská informatika a statistika

DS002 Vědecká konference

B02981 Biomedicine and Biotechnology

MPGS0034 Advances in Molecular Biology and Genetics

Požadavky ke SDZ

• Nejméně 2 původní vědecké práce uveřejněné v časopisech s impaktovým faktorem, a to ve vztahu k tématu dizertace. Nejméně u jedné z nich je doktorand prvním autorem. Jedna přehledová publikace s tématem dizertace doktoranda uveřejněná v časopise s recenzním řízením, kde doktorand je prvním autorem
• Splnění studijních povinností daných studijním plánem

Průběh SDZ:

Zkušební komise je nejméně tříčlenná a je složena ze členů Oborové rady. Při zkoušce je přítomen školitel uchazeče nebo školitelem určený spolupracovník, který se s uchazečem podílel na jeho výzkumu (školitel není členem zkušební komise). Zkouška začne diskuzí o hypotézách připravované dizertační práce. Uchazeč si následně vylosuje dvojici otázek, z nichž jedna bude z experimentální onkologie a jedna z klinické onkologie. Uchazeč si může vyžádat čas na přípravu v délce max. 15 minut.

Zkušební okruhy:

• molekulární a nádorová biologie
• buněčné linie (2D-modely, 3D-organoidy)
• experimentální onkologie na pokusných zvířatech
• preklinická onkologie
• prediktivní patologie
• mikrobiom a mikrobiota
• nádorová imunologie (význam v patogeneze, diagnostice a léčbě)
• klinická onkologie (epidemiologie, screening, diagnostika, léčba, prognóza onemocnění; konsekvence moderní protinádorové terapie; kvalita života pacientů)
• paliativní a tanatologická péče
• translační medicína (v onkologii)

Požadavky na publikační činnost

• Přehledový článek o studované problematice vydaný v recenzovaném časopise (může být i tuzemský časopis bez IF)
• Stěžejní publikace získaných výsledků v mezinárodním časopise s impaktovým faktorem vyšším než 1,5 (student je prvním autorem nejméně jednoho článku s vlastními výsledky, publikovaného in-extenso). Tento stěžejní článek nemůže být pouhým abstraktem, kasuistikou ani přehledovým sdělením.

Požadavky k obhajobě

• absolvování SDZ, splnění všech studijních povinností daných ISP studenta

• OR vyžaduje tři výtisky autoreferátu a dizertace.

Profil absolventa studijního programu

Absolvent doktorského studijního programu Experimentální a klinická onkologie je erudovaným vědeckým pracovníkem, který má rozsáhlé, ucelené, komplexní znalosti současné moderní onkologie, od obecných a experimentálních, přes preklinické až po klinické oblasti onkologie. Osvojil si základní principy vědecké práce. Výsledky své práce je schopen uplatnit počitatelnými scientometrickými výstupy (publikace v odborných časopisech s impaktovým faktorem; prezentace na mezinárodních fórech). Absolvent DSP je schopen samostatně připravit grantovou aplikaci a zajistit tak finanční krytí výzkumu. Doktorand je schopen zapojit se do mezinárodní vědecko-výzkumné spolupráce. Úspěšné dokončení postgraduálního studia je východiskem pro další akademickou dráhu absolventa.