Slaastad H, Wu W, Goullart L, Kanderova V, Tjønnfjord G, Stuchly J, Kalina T, Holm A, Lund-Johansen F. Proteomics. 2011 Dec;11(23):4578–82. doi: 10.1002/pmic.201000744. Epub 2011 Nov 7. IF: 4.815
V impaktovaném časopisu Proteomics zveřejnili práci zabývající se mnohočetnou detekcí buněčných proteinů. Autoři vyvinuli tzv. SEC-MAP techniku, která spočívá v chromatografické separaci buněčných proteinů dle velikosti (SEC) a následné afinitní detekci protilátkami proti buněčným proteinům s pomocí sady barevně rozlišených mikro-kuliček, které umožňují v jedné sadě pracovat s 1725 různými protilátkami. V článku jsou diskutovány metodické aspekty zaručující optimální detekci takto širokého spektra proteinů.
Na využití SEC-MAP techniky jsme se zeptali spoluautora článku, doc. MUDr. Tomáše Kaliny, Ph.D., z KDHO:
Naším cílem je stanovovat kompletní proteom buněk. Tak jako je nyní obvyklé profilovat vzorec všech aktivně přepisovaných genů buněk pomocí „micro-arrays“ čili „expresních čipů“, tak bychom rádi dosáhli možnosti profilovat buněčné proteiny. Tomuto cíli jsme stále velmi vzdáleni, nicméně dokážeme pracovat s detekcí 1725 proteinů zároveň. Využití těchto metod je široké, lze stanovovat expresní proteinové vzorce např. dobrých odpovídačů na konkrétní léčivo či celý léčebný protokol. Tímto směrem míří i naše snaha uplatnit proteinové arrays u dětských leukémií, rozpoznat např. abnormální signální dráhy a hledat slabé místo, na něž se dá zacílit terapií.
-mk-
