- Publikační činnost ústavů a klinik 2. lékařské fakulty z let 2005–2012 spravuje Ústav vědeckých informací 2. LF, výpis na požádání poskytne PhDr. Radim Kubeš, tel. 224 435 848.
- Data po roce 2012 obsahuje databáze OBD, kterou spravuje Univerzita Karlova. Přístupná po přihlášení přes CAS UK i bez přihlášení.
- Sekce Významné publikace – základní údaje o publikacích vybraných podle IF.
Přímé vstupy do databáze OBD po roce 2012 po jednotlivých letech
- Anatomický ústav
- Centrum bioinformatiky
- Dermatovenerologická klinika
- Dětská psychiatrická klinika
- Dětské kardiocentrum
- Farmakologický ústav
- Gynekologicko-porodnická klinika
- Chirurgická klinika
- Chirurgická klinika ÚVN
- Interní klinika
- Kardiologická klinika
- Klinika anesteziologie, resuscitace a intenzivní medicíny
- Klinika dětské a dospělé ortopedie a traumatologie
- Klinika dětské hematologie a onkologie
- Klinika dětské chirurgie
- Klinika dětské neurologie
- Klinika infekčních nemocí
- Klinika kardiovaskulární chirurgie
- Klinika nukleární medicíny a endokrinologie
- Klinika rehabilitace a tělovýchovného lékařství
- Klinika ušní, nosní a krční
- Klinika zobrazovacích metod
- Neurochirurgická klinika dětí a dospělých
- Neurologická klinika
- Oční klinika dětí a dospělých
- Oddělení informačních systémů
- Onkologická klinika
- Pediatrická klinika
- Pneumologická klinika
- Stomatologická klinika dětí a dospělých
- Urologická klinika
- Ústav biofyziky
- Ústav biologie a lékařské genetiky
- Ústav epidemiologie
- Ústav fyziologie
- Ústav histologie a embryologie
- Ústav imunologie
- Ústav jazyků
- Ústav lékařské etiky a humanitních základů medicíny
- Ústav lékařské chemie a klinické biochemie
- Ústav lékařské mikrobiologie
- Ústav neurověd
- Ústav ošetřovatelství
- Ústav patologické fyziologie
- Ústav patologie a molekulární medicíny
- Ústav soudního lékařství
- Ústav tělesné výchovy
- Ústav vědeckých informací
- Ústav veřejného zdravotnictví a preventivního lékařství
- Výukové pracoviště praktického lékařství
