The Effect of DYS-14 Copy Number Variations on Extracellular Fetal DNA Quantification in Maternal Circulation.

Hromadníková I, Benešová M, Zejsková L, Stehnová J, Doucha J, Sedláček P, Dlouhá K, Krofta L. DNA Cell Biol. 2009 Jul;28(7):351–8. IF: 1.988

Článek věnovaný studiu vlivu polymorfismu v počtu kopií DYS-14 sekvence otců na množství extracelulární fetální DNA v cirkulaci těhotných vyšel v časopise DNA and Cell Biology. V publikované práci bylo sledováno, jaký má vliv polymorfismus v počtu kopií DYS-14 sekvence (lokalizované na Y chromozomu) zdravých otců na množství extracelulární fetální DNA v mateřské periferní krvi při nekomplikovaném těhotenství a při těhotenství s placentární insuficiencí. V první části experimentu bylo zjištěno, že je u komplikovaných těhotenství přítomno zvýšené množství extracelulární fetální DNA v mateřské periferní krvi (u plodů mužského pohlaví). Následně se však ukázalo, že počet kopií DYS-14 sekvence v mateřské periferní krvi neodpovídá počtu kopií sekvence v genomu otců a že se v průběhu těhotenství mění. Autoři se proto domnívají, že kvantifikace sekvence DYS-14 není optimálním markerem využitelným k rozlišení mezi normálním a komplikovaným těhotenstvím.
 
Proč jste pozornost zaměřili na sledování právě uvedeného genu DYS-14? Zeptali jsme se doc. RNDr. Ilony Hromadníkové, Ph.D.
Práce řady výzkumných týmů včetně několika našich poukázaly na fakt, že v době onsetu těhotenských komplikací souvisejících s placentární insuficiencí (preeklampsie a/nebo intrauterinní růstová retardace) se nachází zvýšené množství extracelulární DNA ať již fetálního nebo maternálního původu v mateřské cirkulaci. Přestože všechny zmíněné markery (SRY a DYS-14 u plodů mužského pohlaví, β-globin jako „house-keeping“ gen) prokázaly statisticky signifikantně významné zvýšení u placentární insuficience, sensitivita a specificita pro rozlišení patologické a fyziologické gravidity byla jednoznačně nejnižší právě u zmíněné DYS-14 sekvence. Při podrobnější analýze polymorfismu DYS-14 sekvence, o níž se doposud hovořilo jen málo, jsme zjistili, že existuje velká interindividuální variabilita v počtu kopií, jak v genomu dospělých mužů (někteří muži mají ve svém genomu jen 30 kopií a jiní třeba 100 kopií), tak v extracelulární fetální mužské DNA přítomné v mateřské cirkulaci. Proto se domníváme, že variabilita v počtu kopií DYS-14 sekvence může významně výsledky kvantifikace ovlivnit. Původní předpoklad byl takový, že by DYS-14 sekvence mohla být lepším markerem pro neinvazivní detekci pohlaví plodu a kvantifikaci extracelulární mužské fetální DNA v mateřské cirkulaci, protože díky tomu, že se jedná o „multi-copy“ sekvenci, amplifikuje v PCR mnohem dříve než klasické „single-copy“ geny. Od DYS-14 sekvence jsme si všichni slibovali zvýšení sensitivity a specificity testů, avšak, bohužel, opak se ukázal býti pravdou.
 
-az-

Vytvořeno: 23. 7. 2010 / Upraveno: 23. 1. 2019 / prof. MUDr. Radek Špíšek, Ph.D.