The π-helix formation between Asp369 and Thr375 as a key factor in E1-E2 conformational change of Na+/K+-ATPase.

Výzkum molekulového mechanismu Na⁺/K⁺-ATPázy je jedním z předmětů zájmu pracovníků Ústavu biofyziky UK 2. LF. Ve spolupráci s Ústavem experimentální medicíny AV ČR a Ústavem biochemie a endokrinologie University v Giessenu publikovali uvedený článek ve Physiological Research. Popisují zde tvorbu helixu v úseku mezi Asp³⁶⁹ a Thr³⁷⁵, ke kterému dochází v oblasti H₄–H₅ smyčky α₂ podjednotky Na⁺/K⁺-ATPázy při přechodu z E₁ na E₂ konformace. Následkem této změny se zkrátí příslušný úsek mezi P a N doménou.
 
O pár slov k publikované práci jsme poprosili prvního autora publikace, Mgr. Graciana Tejrala.
Výzkum molekulového mechanizmu u Na⁺/K⁺-ATPázy již delší dobu hraje významnou roli při výzkum kardiovaskulárních nemocí a v posledních letech se ukazuje i význam mutací tohoto enzymu při onemocněních jako je familiární hemiplegická migréna druhého typu (FHM2). Naším cílem je pomocí simulací molekulové dynamiky a příbuzných metod popsat jednotlivé fáze enzymatického cyklu, v průběhu kterého dochází k aktivnímu transportu sodných a draselných iontů přes cytoplasmatickou membránu. Energetickým zdrojem transportu je ATP, klíčovým bodem celého cyklu je molekulární mechanismus fosforylace Asp³⁶⁹. V současné době se zaměřujeme na studium větší cytoplasmatické smyčky α podjednotky mezi 4. a 5. transmembránovým segmentem (tzv. H₄–H₅ smyčky), na které dochází k právě zmiňovanému fosforylačnímu procesu. Detailním popsáním a pochopením molekulárního mechanismu funkce Na⁺/K⁺-ATPázy můžeme nejen přispět k léčbě FNM2, ale též některých druhů hypertenze či třeba i muskulární dystrofie.
 
-az-