Genome-wide peripheral blood leukocyte DNA methylation microarrays identified a single association with inflammatory bowel diseases.

Harris RA, Nagy-Szakal D, Pedersen N, Opekun A, Bronsky J, Munkholm P, Jespersgaard C, Andersen P, Melegh B, Ferry G, Jess T, Kellermayer R. Inflamm Bowel Dis. 2012 Dec;18(12):2334–41. doi: 10.1002/ibd.22956. Epub 2012 Mar 29. IF: 4.855

Pediatrická klinika
 
Autoři této práce vyšetřovali, jestli má methylace DNA na svědomí rozvoj IBD. DNA metylace je epigenetická změna, která může být vyvolána prostředím. Protože předchozí studie ukázaly diskordanci ve výskytu IBD u monozygotních dvojčat, existuje důvodné podezření, že právě faktory prostředí ovlivňují vznik tohoto onemocnění. Ukázalo se, že použité celogenomové microarrays nejsou vhodné k prokázání významnější asociace s IBD. Aby bylo možné prokázat asociaci mezi methylací DNA a vznikem IBD, je potřeba použít detailnější nebo více selektivní přístupy.
 
Proč konkrétně nebyly použité mikroarrays vhodné, nám pověděl spoluautor článku, doc. MUDr. Jiří Bronský, Ph.D.:
Genetické příčiny idiopatických střevních zánětů (IBD) jsou dynamicky se rozvíjející oblastí, kde již bylo vytipováno mnoho kandidátních lokusů, nicméně jen v některých případech se podařilo prokázat významnou korelaci s fenotypem onemocnění. Vzhledem k tomu, že IBD mají mnoho fenotypových forem a genetické pozadí onemocnění je velmi komplexní, je pochopitelné, že metoda zaměřená na problém z jediného úhlu pohledu nepřinese vždy konkrétní výstup. K pochopení patogeneze onemocnění a jeho genetického podkladu bude nutné kombinovat poznatky získané z mnoha analýz genomu různými metodami, včetně zvážení možných interakcí mezi jednotlivými kandidátními geny. Navíc stále platí, že genetický výzkum je schopen vysvětlit v dnešní době jen velmi malé procento v rámci patogeneze onemocnění. Významnou roli hrají zejména vlivy zevního prostředí.
 
-Michaela Kotrová-

Vytvořeno: 10. 1. 2014 / Upraveno: 9. 1. 2019 / Mgr. Ing. Tereza Kůstková